Protein–RNA interactions for Protein: P40429

RPL13A, 60S ribosomal protein L13a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP40429 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL13AP40429 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL13AP40429 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL13AP40429 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL13AP40429 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL13AP40429 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL13AP40429 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL13AP40429 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL13AP40429 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL13AP40429 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL13AP40429 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL13AP40429 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL13AP40429 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL13AP40429 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL13AP40429 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL13AP40429 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL13AP40429 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL13AP40429 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL13AP40429 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL13AP40429 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL13AP40429 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL13AP40429 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL13AP40429 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL13AP40429 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL13AP40429 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL13AP40429 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL13AP40429 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL13AP40429 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL13AP40429 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL13AP40429 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL13AP40429 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL13AP40429 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL13AP40429 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL13AP40429 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL13AP40429 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL13AP40429 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL13AP40429 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL13AP40429 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL13AP40429 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL13AP40429 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL13AP40429 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL13AP40429 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL13AP40429 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL13AP40429 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL13AP40429 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL13AP40429 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL13AP40429 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL13AP40429 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL13AP40429 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL13AP40429 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL13AP40429 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL13AP40429 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL13AP40429 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL13AP40429 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL13AP40429 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL13AP40429 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL13AP40429 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL13AP40429 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL13AP40429 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL13AP40429 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL13AP40429 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL13AP40429 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL13AP40429 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL13AP40429 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL13AP40429 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL13AP40429 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL13AP40429 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL13AP40429 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL13AP40429 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL13AP40429 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL13AP40429 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL13AP40429 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL13AP40429 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL13AP40429 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL13AP40429 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL13AP40429 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL13AP40429 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL13AP40429 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL13AP40429 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL13AP40429 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL13AP40429 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL13AP40429 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL13AP40429 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL13AP40429 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL13AP40429 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL13AP40429 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL13AP40429 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL13AP40429 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL13AP40429 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL13AP40429 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL13AP40429 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL13AP40429 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL13AP40429 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL13AP40429 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL13AP40429 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL13AP40429 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL13AP40429 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL13AP40429 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL13AP40429 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL13AP40429 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms