Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXD11P31277 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXD11P31277 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXD11P31277 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXD11P31277 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXD11P31277 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXD11P31277 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXD11P31277 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXD11P31277 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HOXD11P31277 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXD11P31277 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXD11P31277 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXD11P31277 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXD11P31277 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXD11P31277 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXD11P31277 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXD11P31277 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXD11P31277 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXD11P31277 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXD11P31277 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXD11P31277 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXD11P31277 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXD11P31277 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXD11P31277 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXD11P31277 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXD11P31277 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXD11P31277 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXD11P31277 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXD11P31277 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXD11P31277 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXD11P31277 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXD11P31277 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXD11P31277 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXD11P31277 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXD11P31277 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXD11P31277 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXD11P31277 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HOXD11P31277 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HOXD11P31277 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HOXD11P31277 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HOXD11P31277 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HOXD11P31277 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXD11P31277 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HOXD11P31277 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
HOXD11P31277 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HOXD11P31277 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC27.54■■■□□ 2
HOXD11P31277 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
HOXD11P31277 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HOXD11P31277 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HOXD11P31277 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HOXD11P31277 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HOXD11P31277 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXD11P31277 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXD11P31277 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXD11P31277 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXD11P31277 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXD11P31277 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXD11P31277 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
HOXD11P31277 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXD11P31277 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXD11P31277 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXD11P31277 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXD11P31277 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXD11P31277 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXD11P31277 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXD11P31277 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXD11P31277 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXD11P31277 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXD11P31277 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXD11P31277 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXD11P31277 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXD11P31277 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXD11P31277 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXD11P31277 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXD11P31277 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXD11P31277 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXD11P31277 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXD11P31277 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXD11P31277 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXD11P31277 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXD11P31277 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXD11P31277 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXD11P31277 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXD11P31277 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXD11P31277 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXD11P31277 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXD11P31277 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXD11P31277 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXD11P31277 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXD11P31277 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXD11P31277 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXD11P31277 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXD11P31277 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXD11P31277 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXD11P31277 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXD11P31277 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXD11P31277 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXD11P31277 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXD11P31277 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXD11P31277 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms