Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRZ1P23471 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRZ1P23471 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRZ1P23471 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRZ1P23471 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRZ1P23471 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRZ1P23471 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRZ1P23471 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRZ1P23471 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRZ1P23471 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRZ1P23471 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRZ1P23471 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRZ1P23471 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRZ1P23471 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRZ1P23471 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRZ1P23471 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRZ1P23471 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRZ1P23471 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRZ1P23471 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRZ1P23471 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRZ1P23471 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRZ1P23471 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRZ1P23471 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRZ1P23471 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRZ1P23471 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRZ1P23471 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRZ1P23471 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRZ1P23471 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRZ1P23471 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRZ1P23471 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRZ1P23471 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRZ1P23471 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRZ1P23471 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRZ1P23471 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRZ1P23471 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRZ1P23471 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRZ1P23471 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRZ1P23471 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRZ1P23471 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRZ1P23471 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRZ1P23471 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRZ1P23471 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRZ1P23471 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRZ1P23471 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRZ1P23471 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRZ1P23471 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRZ1P23471 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRZ1P23471 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRZ1P23471 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRZ1P23471 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRZ1P23471 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRZ1P23471 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRZ1P23471 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRZ1P23471 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRZ1P23471 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRZ1P23471 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRZ1P23471 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRZ1P23471 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRZ1P23471 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRZ1P23471 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRZ1P23471 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRZ1P23471 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRZ1P23471 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRZ1P23471 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRZ1P23471 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRZ1P23471 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRZ1P23471 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRZ1P23471 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRZ1P23471 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRZ1P23471 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRZ1P23471 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRZ1P23471 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRZ1P23471 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRZ1P23471 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRZ1P23471 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRZ1P23471 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRZ1P23471 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRZ1P23471 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRZ1P23471 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRZ1P23471 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRZ1P23471 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRZ1P23471 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRZ1P23471 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRZ1P23471 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRZ1P23471 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRZ1P23471 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRZ1P23471 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRZ1P23471 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRZ1P23471 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRZ1P23471 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRZ1P23471 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRZ1P23471 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRZ1P23471 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRZ1P23471 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRZ1P23471 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRZ1P23471 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRZ1P23471 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRZ1P23471 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRZ1P23471 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRZ1P23471 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms