Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
XPAP23025 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XPAP23025 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
XPAP23025 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XPAP23025 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
XPAP23025 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
XPAP23025 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
XPAP23025 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
XPAP23025 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
XPAP23025 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
XPAP23025 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XPAP23025 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XPAP23025 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XPAP23025 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XPAP23025 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
XPAP23025 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
XPAP23025 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XPAP23025 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XPAP23025 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XPAP23025 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XPAP23025 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XPAP23025 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XPAP23025 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XPAP23025 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XPAP23025 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XPAP23025 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
XPAP23025 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
XPAP23025 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
XPAP23025 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
XPAP23025 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
XPAP23025 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
XPAP23025 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XPAP23025 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XPAP23025 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XPAP23025 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XPAP23025 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XPAP23025 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XPAP23025 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XPAP23025 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XPAP23025 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
XPAP23025 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
XPAP23025 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
XPAP23025 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
XPAP23025 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
XPAP23025 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XPAP23025 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XPAP23025 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
XPAP23025 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
XPAP23025 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XPAP23025 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
XPAP23025 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
XPAP23025 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
XPAP23025 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
XPAP23025 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XPAP23025 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
XPAP23025 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
XPAP23025 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
XPAP23025 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
XPAP23025 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
XPAP23025 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XPAP23025 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
XPAP23025 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
XPAP23025 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
XPAP23025 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
XPAP23025 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XPAP23025 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XPAP23025 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
XPAP23025 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
XPAP23025 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
XPAP23025 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
XPAP23025 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
XPAP23025 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
XPAP23025 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
XPAP23025 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
XPAP23025 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
XPAP23025 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
XPAP23025 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
XPAP23025 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
XPAP23025 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
XPAP23025 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
XPAP23025 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
XPAP23025 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
XPAP23025 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
XPAP23025 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
XPAP23025 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
XPAP23025 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
XPAP23025 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
XPAP23025 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
XPAP23025 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
XPAP23025 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
XPAP23025 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
XPAP23025 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
XPAP23025 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
XPAP23025 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
XPAP23025 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
XPAP23025 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
XPAP23025 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
XPAP23025 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
XPAP23025 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
XPAP23025 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms