Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCL3P10147 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCL3P10147 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCL3P10147 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCL3P10147 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCL3P10147 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCL3P10147 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCL3P10147 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCL3P10147 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCL3P10147 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCL3P10147 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCL3P10147 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCL3P10147 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCL3P10147 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCL3P10147 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCL3P10147 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCL3P10147 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCL3P10147 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCL3P10147 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCL3P10147 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCL3P10147 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCL3P10147 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCL3P10147 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCL3P10147 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCL3P10147 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCL3P10147 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCL3P10147 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCL3P10147 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCL3P10147 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCL3P10147 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCL3P10147 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCL3P10147 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCL3P10147 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCL3P10147 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCL3P10147 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCL3P10147 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCL3P10147 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCL3P10147 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCL3P10147 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCL3P10147 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCL3P10147 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCL3P10147 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCL3P10147 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCL3P10147 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCL3P10147 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCL3P10147 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCL3P10147 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCL3P10147 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCL3P10147 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCL3P10147 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCL3P10147 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCL3P10147 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCL3P10147 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCL3P10147 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCL3P10147 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCL3P10147 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL3P10147 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL3P10147 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL3P10147 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL3P10147 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCL3P10147 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCL3P10147 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCL3P10147 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCL3P10147 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCL3P10147 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCL3P10147 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCL3P10147 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCL3P10147 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCL3P10147 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCL3P10147 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCL3P10147 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCL3P10147 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCL3P10147 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCL3P10147 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCL3P10147 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCL3P10147 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCL3P10147 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCL3P10147 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCL3P10147 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCL3P10147 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCL3P10147 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCL3P10147 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL3P10147 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL3P10147 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL3P10147 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL3P10147 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL3P10147 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL3P10147 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCL3P10147 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCL3P10147 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCL3P10147 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCL3P10147 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCL3P10147 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCL3P10147 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCL3P10147 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCL3P10147 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCL3P10147 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCL3P10147 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCL3P10147 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCL3P10147 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms