Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
GLI3P10071 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
GLI3P10071 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
GLI3P10071 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
GLI3P10071 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
GLI3P10071 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
GLI3P10071 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
GLI3P10071 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
GLI3P10071 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
GLI3P10071 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
GLI3P10071 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
GLI3P10071 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
GLI3P10071 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
GLI3P10071 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
GLI3P10071 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
GLI3P10071 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
GLI3P10071 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
GLI3P10071 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
GLI3P10071 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
GLI3P10071 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
GLI3P10071 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
GLI3P10071 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
GLI3P10071 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
GLI3P10071 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
GLI3P10071 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
GLI3P10071 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
GLI3P10071 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
GLI3P10071 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
GLI3P10071 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
GLI3P10071 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
GLI3P10071 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
GLI3P10071 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
GLI3P10071 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
GLI3P10071 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
GLI3P10071 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
GLI3P10071 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
GLI3P10071 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
GLI3P10071 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
GLI3P10071 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
GLI3P10071 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
GLI3P10071 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
GLI3P10071 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
GLI3P10071 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
GLI3P10071 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
GLI3P10071 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
GLI3P10071 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
GLI3P10071 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
GLI3P10071 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
GLI3P10071 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
GLI3P10071 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
GLI3P10071 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
GLI3P10071 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
GLI3P10071 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
GLI3P10071 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
GLI3P10071 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
GLI3P10071 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
GLI3P10071 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
GLI3P10071 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
GLI3P10071 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
GLI3P10071 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
GLI3P10071 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
GLI3P10071 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
GLI3P10071 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
GLI3P10071 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.04■■■■□ 3.36
GLI3P10071 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
GLI3P10071 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
GLI3P10071 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
GLI3P10071 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
GLI3P10071 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
GLI3P10071 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
GLI3P10071 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
GLI3P10071 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
GLI3P10071 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
GLI3P10071 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
GLI3P10071 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
GLI3P10071 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
GLI3P10071 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
GLI3P10071 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
GLI3P10071 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
GLI3P10071 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.35
GLI3P10071 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
GLI3P10071 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
GLI3P10071 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
GLI3P10071 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
GLI3P10071 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
GLI3P10071 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
GLI3P10071 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
GLI3P10071 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
GLI3P10071 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
GLI3P10071 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
GLI3P10071 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
GLI3P10071 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
GLI3P10071 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
GLI3P10071 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
GLI3P10071 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
GLI3P10071 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
GLI3P10071 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
GLI3P10071 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
GLI3P10071 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
GLI3P10071 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms