Protein–RNA interactions for Protein: P0C5Y4

KRTAP1-4, Keratin-associated protein 1-4, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-4P0C5Y4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-4P0C5Y4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-4P0C5Y4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP1-4P0C5Y4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP1-4P0C5Y4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP1-4P0C5Y4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP1-4P0C5Y4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP1-4P0C5Y4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP1-4P0C5Y4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP1-4P0C5Y4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP1-4P0C5Y4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP1-4P0C5Y4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP1-4P0C5Y4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP1-4P0C5Y4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP1-4P0C5Y4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP1-4P0C5Y4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP1-4P0C5Y4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP1-4P0C5Y4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP1-4P0C5Y4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP1-4P0C5Y4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP1-4P0C5Y4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP1-4P0C5Y4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP1-4P0C5Y4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP1-4P0C5Y4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP1-4P0C5Y4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP1-4P0C5Y4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP1-4P0C5Y4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP1-4P0C5Y4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP1-4P0C5Y4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP1-4P0C5Y4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP1-4P0C5Y4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP1-4P0C5Y4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP1-4P0C5Y4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP1-4P0C5Y4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP1-4P0C5Y4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP1-4P0C5Y4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP1-4P0C5Y4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP1-4P0C5Y4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP1-4P0C5Y4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP1-4P0C5Y4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP1-4P0C5Y4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP1-4P0C5Y4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP1-4P0C5Y4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP1-4P0C5Y4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP1-4P0C5Y4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP1-4P0C5Y4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP1-4P0C5Y4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP1-4P0C5Y4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP1-4P0C5Y4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP1-4P0C5Y4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP1-4P0C5Y4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP1-4P0C5Y4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP1-4P0C5Y4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP1-4P0C5Y4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP1-4P0C5Y4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP1-4P0C5Y4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP1-4P0C5Y4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP1-4P0C5Y4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP1-4P0C5Y4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP1-4P0C5Y4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP1-4P0C5Y4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP1-4P0C5Y4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP1-4P0C5Y4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRTAP1-4P0C5Y4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRTAP1-4P0C5Y4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRTAP1-4P0C5Y4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRTAP1-4P0C5Y4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRTAP1-4P0C5Y4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRTAP1-4P0C5Y4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KRTAP1-4P0C5Y4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KRTAP1-4P0C5Y4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRTAP1-4P0C5Y4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP1-4P0C5Y4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP1-4P0C5Y4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP1-4P0C5Y4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP1-4P0C5Y4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP1-4P0C5Y4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP1-4P0C5Y4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP1-4P0C5Y4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP1-4P0C5Y4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP1-4P0C5Y4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP1-4P0C5Y4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP1-4P0C5Y4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP1-4P0C5Y4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP1-4P0C5Y4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP1-4P0C5Y4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP1-4P0C5Y4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP1-4P0C5Y4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP1-4P0C5Y4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP1-4P0C5Y4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP1-4P0C5Y4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP1-4P0C5Y4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP1-4P0C5Y4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP1-4P0C5Y4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP1-4P0C5Y4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP1-4P0C5Y4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP1-4P0C5Y4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP1-4P0C5Y4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP1-4P0C5Y4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP1-4P0C5Y4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms