Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
VIL1P09327 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
VIL1P09327 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
VIL1P09327 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
VIL1P09327 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
VIL1P09327 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
VIL1P09327 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
VIL1P09327 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
VIL1P09327 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
VIL1P09327 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
VIL1P09327 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
VIL1P09327 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
VIL1P09327 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
VIL1P09327 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.66■■■□□ 2.82
VIL1P09327 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
VIL1P09327 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
VIL1P09327 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
VIL1P09327 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
VIL1P09327 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
VIL1P09327 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
VIL1P09327 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
VIL1P09327 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
VIL1P09327 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
VIL1P09327 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
VIL1P09327 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
VIL1P09327 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
VIL1P09327 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
VIL1P09327 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
VIL1P09327 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
VIL1P09327 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
VIL1P09327 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
VIL1P09327 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
VIL1P09327 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
VIL1P09327 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.8
VIL1P09327 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
VIL1P09327 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
VIL1P09327 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.55■■■□□ 2.8
VIL1P09327 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
VIL1P09327 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
VIL1P09327 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
VIL1P09327 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
VIL1P09327 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
VIL1P09327 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
VIL1P09327 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
VIL1P09327 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
VIL1P09327 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
VIL1P09327 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
VIL1P09327 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
VIL1P09327 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
VIL1P09327 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
VIL1P09327 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
VIL1P09327 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
VIL1P09327 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
VIL1P09327 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
VIL1P09327 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
VIL1P09327 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
VIL1P09327 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
VIL1P09327 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
VIL1P09327 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
VIL1P09327 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
VIL1P09327 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
VIL1P09327 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
VIL1P09327 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
VIL1P09327 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
VIL1P09327 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
VIL1P09327 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
VIL1P09327 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
VIL1P09327 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
VIL1P09327 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
VIL1P09327 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
VIL1P09327 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.36■■■□□ 2.77
VIL1P09327 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
VIL1P09327 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
VIL1P09327 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
VIL1P09327 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
VIL1P09327 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
VIL1P09327 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
VIL1P09327 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
VIL1P09327 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
VIL1P09327 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
VIL1P09327 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
VIL1P09327 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
VIL1P09327 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
VIL1P09327 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
VIL1P09327 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
VIL1P09327 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
VIL1P09327 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
VIL1P09327 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
VIL1P09327 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
VIL1P09327 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
VIL1P09327 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
VIL1P09327 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
VIL1P09327 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
VIL1P09327 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
VIL1P09327 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
VIL1P09327 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
VIL1P09327 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
VIL1P09327 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
VIL1P09327 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
VIL1P09327 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms