Protein–RNA interactions for Protein: O75417

POLQ, DNA polymerase theta, humanhuman

Predictions only

Length 2,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLQO75417 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POLQO75417 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POLQO75417 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POLQO75417 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POLQO75417 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLQO75417 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLQO75417 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLQO75417 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLQO75417 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
POLQO75417 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLQO75417 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLQO75417 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLQO75417 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLQO75417 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLQO75417 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
POLQO75417 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLQO75417 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLQO75417 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLQO75417 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLQO75417 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLQO75417 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLQO75417 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLQO75417 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLQO75417 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLQO75417 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLQO75417 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLQO75417 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POLQO75417 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLQO75417 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLQO75417 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLQO75417 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLQO75417 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLQO75417 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLQO75417 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLQO75417 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLQO75417 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLQO75417 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLQO75417 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POLQO75417 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLQO75417 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLQO75417 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLQO75417 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLQO75417 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLQO75417 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLQO75417 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLQO75417 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLQO75417 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLQO75417 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLQO75417 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLQO75417 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POLQO75417 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POLQO75417 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POLQO75417 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POLQO75417 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POLQO75417 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POLQO75417 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POLQO75417 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POLQO75417 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POLQO75417 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLQO75417 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
POLQO75417 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLQO75417 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLQO75417 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLQO75417 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
POLQO75417 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLQO75417 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLQO75417 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLQO75417 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLQO75417 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLQO75417 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLQO75417 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
POLQO75417 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
POLQO75417 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLQO75417 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLQO75417 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLQO75417 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLQO75417 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLQO75417 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLQO75417 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLQO75417 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLQO75417 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLQO75417 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLQO75417 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLQO75417 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLQO75417 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLQO75417 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLQO75417 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLQO75417 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLQO75417 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLQO75417 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLQO75417 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLQO75417 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLQO75417 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLQO75417 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLQO75417 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLQO75417 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLQO75417 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLQO75417 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLQO75417 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLQO75417 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms