Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
PLXNC1O60486 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC40.65■■■■■ 4.1
PLXNC1O60486 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC40.65■■■■■ 4.1
PLXNC1O60486 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC40.65■■■■■ 4.1
PLXNC1O60486 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
PLXNC1O60486 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC40.64■■■■■ 4.1
PLXNC1O60486 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
PLXNC1O60486 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
PLXNC1O60486 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
PLXNC1O60486 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
PLXNC1O60486 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
PLXNC1O60486 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
PLXNC1O60486 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
PLXNC1O60486 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
PLXNC1O60486 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
PLXNC1O60486 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC40.59■■■■■ 4.09
PLXNC1O60486 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
PLXNC1O60486 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
PLXNC1O60486 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
PLXNC1O60486 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
PLXNC1O60486 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
PLXNC1O60486 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
PLXNC1O60486 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
PLXNC1O60486 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
PLXNC1O60486 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
PLXNC1O60486 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
PLXNC1O60486 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
PLXNC1O60486 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC40.52■■■■■ 4.08
PLXNC1O60486 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
PLXNC1O60486 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
PLXNC1O60486 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
PLXNC1O60486 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
PLXNC1O60486 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
PLXNC1O60486 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
PLXNC1O60486 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
PLXNC1O60486 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
PLXNC1O60486 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
PLXNC1O60486 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
PLXNC1O60486 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
PLXNC1O60486 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC40.48■■■■■ 4.07
PLXNC1O60486 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
PLXNC1O60486 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
PLXNC1O60486 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
PLXNC1O60486 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
PLXNC1O60486 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
PLXNC1O60486 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC40.45■■■■■ 4.07
PLXNC1O60486 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
PLXNC1O60486 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
PLXNC1O60486 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
PLXNC1O60486 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
PLXNC1O60486 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
PLXNC1O60486 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
PLXNC1O60486 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
PLXNC1O60486 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
PLXNC1O60486 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
PLXNC1O60486 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
PLXNC1O60486 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
PLXNC1O60486 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
PLXNC1O60486 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
PLXNC1O60486 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC40.35■■■■■ 4.05
PLXNC1O60486 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
PLXNC1O60486 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
PLXNC1O60486 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
PLXNC1O60486 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC40.32■■■■■ 4.05
PLXNC1O60486 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
PLXNC1O60486 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
PLXNC1O60486 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
PLXNC1O60486 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
PLXNC1O60486 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
PLXNC1O60486 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
PLXNC1O60486 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
PLXNC1O60486 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
PLXNC1O60486 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
PLXNC1O60486 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC40.28■■■■■ 4.04
PLXNC1O60486 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
PLXNC1O60486 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
PLXNC1O60486 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
PLXNC1O60486 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
PLXNC1O60486 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
PLXNC1O60486 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
PLXNC1O60486 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
PLXNC1O60486 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
PLXNC1O60486 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
PLXNC1O60486 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
PLXNC1O60486 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
PLXNC1O60486 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
PLXNC1O60486 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
PLXNC1O60486 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
PLXNC1O60486 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
PLXNC1O60486 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
PLXNC1O60486 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
PLXNC1O60486 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
PLXNC1O60486 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
PLXNC1O60486 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
PLXNC1O60486 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
PLXNC1O60486 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
PLXNC1O60486 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
PLXNC1O60486 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
PLXNC1O60486 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC40.11■■■■■ 4.01
PLXNC1O60486 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms