Protein–RNA interactions for Protein: O15522

NKX2-8, Homeobox protein Nkx-2.8, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-8O15522 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX2-8O15522 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX2-8O15522 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX2-8O15522 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX2-8O15522 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKX2-8O15522 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKX2-8O15522 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NKX2-8O15522 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NKX2-8O15522 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NKX2-8O15522 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NKX2-8O15522 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NKX2-8O15522 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NKX2-8O15522 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NKX2-8O15522 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NKX2-8O15522 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NKX2-8O15522 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKX2-8O15522 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKX2-8O15522 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKX2-8O15522 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKX2-8O15522 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NKX2-8O15522 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NKX2-8O15522 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NKX2-8O15522 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NKX2-8O15522 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NKX2-8O15522 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKX2-8O15522 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NKX2-8O15522 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKX2-8O15522 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKX2-8O15522 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKX2-8O15522 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NKX2-8O15522 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NKX2-8O15522 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NKX2-8O15522 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKX2-8O15522 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKX2-8O15522 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKX2-8O15522 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NKX2-8O15522 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NKX2-8O15522 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NKX2-8O15522 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NKX2-8O15522 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NKX2-8O15522 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NKX2-8O15522 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NKX2-8O15522 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NKX2-8O15522 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NKX2-8O15522 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NKX2-8O15522 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NKX2-8O15522 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NKX2-8O15522 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NKX2-8O15522 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX2-8O15522 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX2-8O15522 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX2-8O15522 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX2-8O15522 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX2-8O15522 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX2-8O15522 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX2-8O15522 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX2-8O15522 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX2-8O15522 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX2-8O15522 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX2-8O15522 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX2-8O15522 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX2-8O15522 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKX2-8O15522 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKX2-8O15522 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NKX2-8O15522 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NKX2-8O15522 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NKX2-8O15522 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NKX2-8O15522 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NKX2-8O15522 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NKX2-8O15522 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NKX2-8O15522 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NKX2-8O15522 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NKX2-8O15522 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NKX2-8O15522 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NKX2-8O15522 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NKX2-8O15522 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NKX2-8O15522 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NKX2-8O15522 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NKX2-8O15522 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NKX2-8O15522 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NKX2-8O15522 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NKX2-8O15522 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NKX2-8O15522 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NKX2-8O15522 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NKX2-8O15522 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NKX2-8O15522 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NKX2-8O15522 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NKX2-8O15522 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKX2-8O15522 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX2-8O15522 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX2-8O15522 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX2-8O15522 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX2-8O15522 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX2-8O15522 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NKX2-8O15522 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NKX2-8O15522 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NKX2-8O15522 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKX2-8O15522 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKX2-8O15522 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKX2-8O15522 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms