Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.38■■■■■ 4.38
KDM6BO15054 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
KDM6BO15054 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
KDM6BO15054 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
KDM6BO15054 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
KDM6BO15054 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC42.34■■■■■ 4.37
KDM6BO15054 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
KDM6BO15054 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
KDM6BO15054 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
KDM6BO15054 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
KDM6BO15054 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
KDM6BO15054 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC42.28■■■■■ 4.36
KDM6BO15054 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
KDM6BO15054 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
KDM6BO15054 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
KDM6BO15054 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
KDM6BO15054 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
KDM6BO15054 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
KDM6BO15054 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
KDM6BO15054 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC42.19■■■■■ 4.34
KDM6BO15054 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
KDM6BO15054 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
KDM6BO15054 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
KDM6BO15054 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
KDM6BO15054 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
KDM6BO15054 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC42.15■■■■■ 4.34
KDM6BO15054 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
KDM6BO15054 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC42.13■■■■■ 4.33
KDM6BO15054 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC42.13■■■■■ 4.33
KDM6BO15054 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
KDM6BO15054 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
KDM6BO15054 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
KDM6BO15054 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC42.11■■■■■ 4.33
KDM6BO15054 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
KDM6BO15054 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC42.06■■■■■ 4.32
KDM6BO15054 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
KDM6BO15054 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
KDM6BO15054 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
KDM6BO15054 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
KDM6BO15054 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
KDM6BO15054 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
KDM6BO15054 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
KDM6BO15054 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC42.04■■■■■ 4.32
KDM6BO15054 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
KDM6BO15054 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
KDM6BO15054 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
KDM6BO15054 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
KDM6BO15054 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
KDM6BO15054 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC42■■■■■ 4.31
KDM6BO15054 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC41.99■■■■■ 4.31
KDM6BO15054 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC41.98■■■■■ 4.31
KDM6BO15054 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
KDM6BO15054 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC41.98■■■■■ 4.31
KDM6BO15054 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
KDM6BO15054 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
KDM6BO15054 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC41.96■■■■■ 4.31
KDM6BO15054 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
KDM6BO15054 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
KDM6BO15054 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
KDM6BO15054 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
KDM6BO15054 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC41.92■■■■■ 4.3
KDM6BO15054 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
KDM6BO15054 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.3
KDM6BO15054 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC41.82■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
KDM6BO15054 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
KDM6BO15054 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
KDM6BO15054 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
KDM6BO15054 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
KDM6BO15054 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
KDM6BO15054 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
KDM6BO15054 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
KDM6BO15054 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
KDM6BO15054 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
KDM6BO15054 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
KDM6BO15054 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
KDM6BO15054 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
KDM6BO15054 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC41.77■■■■■ 4.28
KDM6BO15054 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms