Protein–RNA interactions for Protein: A6NHY6

C9orf118, Putative uncharacterized protein C9orf118, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf118A6NHY6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf118A6NHY6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf118A6NHY6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf118A6NHY6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf118A6NHY6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf118A6NHY6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf118A6NHY6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf118A6NHY6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf118A6NHY6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf118A6NHY6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf118A6NHY6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf118A6NHY6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf118A6NHY6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf118A6NHY6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf118A6NHY6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf118A6NHY6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf118A6NHY6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf118A6NHY6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf118A6NHY6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf118A6NHY6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf118A6NHY6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf118A6NHY6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf118A6NHY6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf118A6NHY6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf118A6NHY6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf118A6NHY6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C9orf118A6NHY6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf118A6NHY6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf118A6NHY6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf118A6NHY6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf118A6NHY6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf118A6NHY6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf118A6NHY6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf118A6NHY6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf118A6NHY6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf118A6NHY6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf118A6NHY6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf118A6NHY6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf118A6NHY6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf118A6NHY6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf118A6NHY6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf118A6NHY6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf118A6NHY6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf118A6NHY6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf118A6NHY6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf118A6NHY6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf118A6NHY6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf118A6NHY6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf118A6NHY6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf118A6NHY6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf118A6NHY6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf118A6NHY6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf118A6NHY6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf118A6NHY6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf118A6NHY6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf118A6NHY6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf118A6NHY6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf118A6NHY6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf118A6NHY6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf118A6NHY6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf118A6NHY6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf118A6NHY6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf118A6NHY6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf118A6NHY6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf118A6NHY6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf118A6NHY6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf118A6NHY6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf118A6NHY6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf118A6NHY6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf118A6NHY6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf118A6NHY6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf118A6NHY6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf118A6NHY6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf118A6NHY6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf118A6NHY6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf118A6NHY6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf118A6NHY6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf118A6NHY6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf118A6NHY6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf118A6NHY6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf118A6NHY6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf118A6NHY6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf118A6NHY6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf118A6NHY6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf118A6NHY6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf118A6NHY6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf118A6NHY6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf118A6NHY6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf118A6NHY6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf118A6NHY6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf118A6NHY6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf118A6NHY6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf118A6NHY6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf118A6NHY6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf118A6NHY6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf118A6NHY6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf118A6NHY6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf118A6NHY6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf118A6NHY6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf118A6NHY6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms