Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRP5LA4QPB2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRP5LA4QPB2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRP5LA4QPB2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRP5LA4QPB2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRP5LA4QPB2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRP5LA4QPB2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRP5LA4QPB2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRP5LA4QPB2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRP5LA4QPB2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRP5LA4QPB2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRP5LA4QPB2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRP5LA4QPB2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRP5LA4QPB2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRP5LA4QPB2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRP5LA4QPB2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LRP5LA4QPB2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRP5LA4QPB2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRP5LA4QPB2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRP5LA4QPB2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRP5LA4QPB2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRP5LA4QPB2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRP5LA4QPB2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRP5LA4QPB2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRP5LA4QPB2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRP5LA4QPB2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP5LA4QPB2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP5LA4QPB2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP5LA4QPB2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP5LA4QPB2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP5LA4QPB2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP5LA4QPB2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP5LA4QPB2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP5LA4QPB2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRP5LA4QPB2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP5LA4QPB2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRP5LA4QPB2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRP5LA4QPB2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRP5LA4QPB2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRP5LA4QPB2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP5LA4QPB2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP5LA4QPB2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP5LA4QPB2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP5LA4QPB2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP5LA4QPB2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP5LA4QPB2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP5LA4QPB2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP5LA4QPB2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRP5LA4QPB2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP5LA4QPB2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP5LA4QPB2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRP5LA4QPB2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP5LA4QPB2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP5LA4QPB2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRP5LA4QPB2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP5LA4QPB2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP5LA4QPB2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRP5LA4QPB2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP5LA4QPB2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP5LA4QPB2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRP5LA4QPB2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRP5LA4QPB2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP5LA4QPB2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP5LA4QPB2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRP5LA4QPB2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP5LA4QPB2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRP5LA4QPB2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP5LA4QPB2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP5LA4QPB2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP5LA4QPB2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP5LA4QPB2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRP5LA4QPB2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP5LA4QPB2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRP5LA4QPB2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP5LA4QPB2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP5LA4QPB2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRP5LA4QPB2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP5LA4QPB2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRP5LA4QPB2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRP5LA4QPB2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRP5LA4QPB2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRP5LA4QPB2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRP5LA4QPB2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRP5LA4QPB2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRP5LA4QPB2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRP5LA4QPB2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRP5LA4QPB2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRP5LA4QPB2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRP5LA4QPB2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRP5LA4QPB2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRP5LA4QPB2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRP5LA4QPB2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRP5LA4QPB2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP5LA4QPB2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP5LA4QPB2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP5LA4QPB2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP5LA4QPB2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP5LA4QPB2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP5LA4QPB2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP5LA4QPB2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms