Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3CQ99985 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms