Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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