Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RXRAP19793 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RXRAP19793 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RXRAP19793 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RXRAP19793 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RXRAP19793 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RXRAP19793 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RXRAP19793 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RXRAP19793 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RXRAP19793 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RXRAP19793 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RXRAP19793 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RXRAP19793 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RXRAP19793 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RXRAP19793 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RXRAP19793 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RXRAP19793 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RXRAP19793 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RXRAP19793 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RXRAP19793 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RXRAP19793 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RXRAP19793 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RXRAP19793 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RXRAP19793 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RXRAP19793 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RXRAP19793 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RXRAP19793 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RXRAP19793 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RXRAP19793 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RXRAP19793 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RXRAP19793 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RXRAP19793 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RXRAP19793 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RXRAP19793 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RXRAP19793 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RXRAP19793 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RXRAP19793 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RXRAP19793 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RXRAP19793 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RXRAP19793 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RXRAP19793 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RXRAP19793 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RXRAP19793 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RXRAP19793 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RXRAP19793 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RXRAP19793 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RXRAP19793 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RXRAP19793 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RXRAP19793 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RXRAP19793 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RXRAP19793 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RXRAP19793 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RXRAP19793 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RXRAP19793 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RXRAP19793 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RXRAP19793 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RXRAP19793 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RXRAP19793 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RXRAP19793 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RXRAP19793 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RXRAP19793 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RXRAP19793 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RXRAP19793 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RXRAP19793 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RXRAP19793 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RXRAP19793 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RXRAP19793 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RXRAP19793 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RXRAP19793 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RXRAP19793 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RXRAP19793 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RXRAP19793 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RXRAP19793 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RXRAP19793 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RXRAP19793 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RXRAP19793 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RXRAP19793 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RXRAP19793 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RXRAP19793 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RXRAP19793 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RXRAP19793 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RXRAP19793 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RXRAP19793 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RXRAP19793 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RXRAP19793 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RXRAP19793 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RXRAP19793 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RXRAP19793 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RXRAP19793 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RXRAP19793 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RXRAP19793 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RXRAP19793 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RXRAP19793 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RXRAP19793 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RXRAP19793 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RXRAP19793 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RXRAP19793 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RXRAP19793 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RXRAP19793 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RXRAP19793 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms