Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TK1P04183 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TK1P04183 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TK1P04183 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TK1P04183 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TK1P04183 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TK1P04183 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TK1P04183 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TK1P04183 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TK1P04183 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TK1P04183 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TK1P04183 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TK1P04183 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TK1P04183 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TK1P04183 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TK1P04183 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TK1P04183 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TK1P04183 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TK1P04183 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TK1P04183 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TK1P04183 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TK1P04183 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TK1P04183 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TK1P04183 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TK1P04183 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TK1P04183 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TK1P04183 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TK1P04183 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TK1P04183 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TK1P04183 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TK1P04183 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TK1P04183 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TK1P04183 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TK1P04183 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TK1P04183 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TK1P04183 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TK1P04183 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TK1P04183 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TK1P04183 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TK1P04183 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TK1P04183 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TK1P04183 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TK1P04183 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TK1P04183 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TK1P04183 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TK1P04183 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TK1P04183 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TK1P04183 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TK1P04183 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TK1P04183 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TK1P04183 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TK1P04183 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TK1P04183 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TK1P04183 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TK1P04183 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TK1P04183 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TK1P04183 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TK1P04183 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TK1P04183 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TK1P04183 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TK1P04183 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TK1P04183 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TK1P04183 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TK1P04183 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TK1P04183 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TK1P04183 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TK1P04183 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TK1P04183 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TK1P04183 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TK1P04183 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TK1P04183 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TK1P04183 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TK1P04183 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TK1P04183 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TK1P04183 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TK1P04183 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TK1P04183 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TK1P04183 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TK1P04183 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TK1P04183 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TK1P04183 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TK1P04183 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TK1P04183 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TK1P04183 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TK1P04183 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TK1P04183 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TK1P04183 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TK1P04183 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TK1P04183 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TK1P04183 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TK1P04183 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TK1P04183 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TK1P04183 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TK1P04183 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TK1P04183 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TK1P04183 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TK1P04183 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TK1P04183 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TK1P04183 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TK1P04183 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms