Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
ARID3CA6NKF2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
ARID3CA6NKF2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ARID3CA6NKF2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ARID3CA6NKF2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ARID3CA6NKF2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
ARID3CA6NKF2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
ARID3CA6NKF2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC33.01■■■□□ 2.87
ARID3CA6NKF2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
ARID3CA6NKF2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
ARID3CA6NKF2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ARID3CA6NKF2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
ARID3CA6NKF2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ARID3CA6NKF2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ARID3CA6NKF2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ARID3CA6NKF2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
ARID3CA6NKF2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
ARID3CA6NKF2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ARID3CA6NKF2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC33■■■□□ 2.87
ARID3CA6NKF2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC33■■■□□ 2.87
ARID3CA6NKF2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC33■■■□□ 2.87
ARID3CA6NKF2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
ARID3CA6NKF2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ARID3CA6NKF2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ARID3CA6NKF2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ARID3CA6NKF2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ARID3CA6NKF2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ARID3CA6NKF2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ARID3CA6NKF2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ARID3CA6NKF2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms