Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 WDR45-235ENST00000634849 918 ntTSL 315.42■□□□□ 0.061e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.041e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 COL4A5-203ENST00000470339 782 ntTSL 315.17■□□□□ 0.021e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 WDR45-242ENST00000635344 737 ntTSL 515.12■□□□□ 0.011e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 SEC11C-203ENST00000585864 1088 ntTSL 1 (best)15.1■□□□□ 0.011e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 DLGAP4-208ENST00000478910 2674 ntTSL 214.83□□□□□ -0.031e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 RCC1L-206ENST00000618102 950 ntTSL 214.72□□□□□ -0.051e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.066e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 WDR45-214ENST00000465431 1069 ntTSL 314.68□□□□□ -0.061e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 WDR45-219ENST00000474053 728 ntTSL 514.61□□□□□ -0.071e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.071e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 CES3-206ENST00000566746 587 ntTSL 414.47□□□□□ -0.091e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.111e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 WDR45-220ENST00000475880 872 ntTSL 514.35□□□□□ -0.111e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 VPS39-210ENST00000568357 593 ntTSL 214.32□□□□□ -0.121e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 DHX29-202ENST00000504778 4557 ntTSL 1 (best)14□□□□□ -0.171e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 CTAGE5-216ENST00000556990 568 ntTSL 413.8□□□□□ -0.26e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 DDAH1-201ENST00000284031 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.251e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 WDR45-209ENST00000419567 643 ntTSL 513.44□□□□□ -0.261e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 WDR45-213ENST00000465382 811 ntTSL 513.44□□□□□ -0.261e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 DHX29-203ENST00000508346 479 ntTSL 313.36□□□□□ -0.271e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.296e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 WDR45-229ENST00000634522 545 ntTSL 513.22□□□□□ -0.291e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 MMP11-203ENST00000434318 1165 ntTSL 513.21□□□□□ -0.291e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 USP36-206ENST00000586896 696 ntTSL 513.21□□□□□ -0.291e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 MAGI2-AS3-222ENST00000618186 402 ntTSL 513.17□□□□□ -0.31e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.321e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 PPIG-205ENST00000418888 525 ntTSL 412.96□□□□□ -0.336e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.353e-17■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 CTAGE5-202ENST00000280083 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.366e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 CHST15-202ENST00000435907 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.376e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 MTUS1-225ENST00000523718 3354 ntTSL 1 (best)12.67□□□□□ -0.381e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 WDR45-227ENST00000634390 492 ntTSL 412.49□□□□□ -0.411e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 SHC1-211ENST00000490667 727 ntTSL 212.46□□□□□ -0.411e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 SEC11C-201ENST00000299714 727 ntTSL 512.26□□□□□ -0.451e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 FLNB-206ENST00000468939 573 ntTSL 212.24□□□□□ -0.456e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 SEC11C-208ENST00000593132 586 ntTSL 312.23□□□□□ -0.451e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 SH3YL1-204ENST00000403658 1279 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.461e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 SH3YL1-220ENST00000475027 599 ntTSL 512.17□□□□□ -0.461e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 VPS39-201ENST00000318006 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.461e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 CTAGE5-206ENST00000396158 3695 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.476e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 WDR45-210ENST00000423215 816 ntTSL 512.06□□□□□ -0.481e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 RBM12-206ENST00000435161 565 ntTSL 412.01□□□□□ -0.493e-17■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 SH3YL1-209ENST00000451005 782 ntTSL 511.92□□□□□ -0.51e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 WDR45-216ENST00000471338 699 ntTSL 511.91□□□□□ -0.51e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 COL4A5-201ENST00000328300 6483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.511e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 COL4A5-202ENST00000361603 6469 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.511e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 MAGI2-AS3-220ENST00000616796 712 ntTSL 511.87□□□□□ -0.511e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 CHST15-205ENST00000628426 3553 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.526e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 DHX29-205ENST00000621106 4450 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.561e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 SH3YL1-226ENST00000497051 533 ntTSL 511.3□□□□□ -0.61e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 WDR45-204ENST00000376357 567 ntTSL 211.25□□□□□ -0.611e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 MAGI2-AS3-205ENST00000429408 634 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.611e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 RBM12-205ENST00000431148 583 ntTSL 411.25□□□□□ -0.613e-17■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 SH3YL1-210ENST00000454318 581 ntTSL 311.23□□□□□ -0.611e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 PRPF8-215ENST00000576958 416 ntTSL 211.12□□□□□ -0.631e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 AKR1C3-209ENST00000605149 1405 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.656e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 RABGEF1-207ENST00000484547 1596 ntTSL 1 (best)11.01□□□□□ -0.651e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 MAGI2-AS3-217ENST00000613892 455 ntTSL 510.87□□□□□ -0.671e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 WDR45-241ENST00000635329 167 ntTSL 510.72□□□□□ -0.691e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 GLUL-205ENST00000461447 689 ntTSL 210.64□□□□□ -0.711e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 CTAGE5-203ENST00000341502 4091 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.716e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 PPIG-202ENST00000409714 2615 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.726e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 PPIG-208ENST00000462903 1516 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.726e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 PPP6R1-208ENST00000592242 574 ntTSL 410.44□□□□□ -0.741e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 ASH1L-201ENST00000368346 11942 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.751e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 SPTAN1-228ENST00000635853 5870 ntTSL 510.29□□□□□ -0.761e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 MAN2C1-239ENST00000569069 573 ntTSL 410.16□□□□□ -0.781e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 SSFA2-203ENST00000409136 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.791e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 SPTAN1-206ENST00000475367 2237 ntTSL 210.08□□□□□ -0.81e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 FREM1-202ENST00000380880 7324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.811e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 SH3YL1-219ENST00000473104 2463 ntTSL 1 (best)9.96□□□□□ -0.821e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 RBM12-203ENST00000374114 6662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.823e-17■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 DHX29-201ENST00000251636 4502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.831e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 SH3YL1-208ENST00000431160 721 ntTSL 29.89□□□□□ -0.831e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 SH3YL1-229ENST00000626873 1973 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.841e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 FREM1-201ENST00000380875 6126 ntTSL 1 (best)9.72□□□□□ -0.851e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 FREM1-204ENST00000422223 10086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.861e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 SH3YL1-202ENST00000402632 3151 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.91e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 SH3YL1-222ENST00000479739 2236 ntTSL 29.41□□□□□ -0.91e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 PPIG-211ENST00000530152 690 ntTSL 39.39□□□□□ -0.916e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 FREM1-203ENST00000380894 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.911e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 AKR1C3-201ENST00000380554 1807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.926e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 AKR1C3-202ENST00000439082 972 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.926e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 SH3YL1-225ENST00000488979 541 ntTSL 59.17□□□□□ -0.941e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 FREM1-205ENST00000427623 1421 ntTSL 59.15□□□□□ -0.941e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 COL4A5-204ENST00000477429 564 ntTSL 1 (best)8.89□□□□□ -0.991e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 MAGI2-AS3-226ENST00000629211 428 ntTSL 58.87□□□□□ -0.991e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 RABGEF1-203ENST00000439720 3065 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.011e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 SH3YL1-215ENST00000468321 2739 ntTSL 1 (best)8.52□□□□□ -1.051e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 DDAH1-202ENST00000426972 4017 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.071e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 SH3YL1-205ENST00000403712 1695 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.071e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 MBNL2-206ENST00000469707 2574 ntTSL 1 (best)8.3□□□□□ -1.081e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 CCDC82-207ENST00000538597 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 37.99□□□□□ -1.136e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 PIP5K1A-210ENST00000460157 554 ntTSL 47.86□□□□□ -1.151e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 TMEM87B-204ENST00000463427 637 ntTSL 37.81□□□□□ -1.166e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.171e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 SSFA2-204ENST00000416081 5067 ntTSL 1 (best)7.63□□□□□ -1.191e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 MLEC-204ENST00000535656 543 ntTSL 37.23□□□□□ -1.251e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 MLEC-205ENST00000545525 549 ntTSL 27.23□□□□□ -1.251e-5■□□□□ 8.3
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