Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8A1Q9Y2Q0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8A1Q9Y2Q0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms