Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
FOXD3Q9UJU5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXD3Q9UJU5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms