Protein–RNA interactions for Protein: Q96B42

TMEM18, Transmembrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM18Q96B42 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM18Q96B42 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM18Q96B42 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms