Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC47Q96A33 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
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