Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOHLH1Q5JUK2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms