Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPIRE1Q08AE8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms