Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COPB1P53618 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COPB1P53618 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPB1P53618 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPB1P53618 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPB1P53618 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COPB1P53618 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPB1P53618 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPB1P53618 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPB1P53618 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPB1P53618 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPB1P53618 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COPB1P53618 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB1P53618 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB1P53618 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB1P53618 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB1P53618 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB1P53618 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB1P53618 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB1P53618 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB1P53618 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB1P53618 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB1P53618 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB1P53618 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB1P53618 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB1P53618 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB1P53618 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB1P53618 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB1P53618 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB1P53618 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB1P53618 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB1P53618 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB1P53618 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB1P53618 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPB1P53618 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPB1P53618 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPB1P53618 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPB1P53618 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPB1P53618 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPB1P53618 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPB1P53618 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
COPB1P53618 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPB1P53618 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPB1P53618 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPB1P53618 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPB1P53618 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPB1P53618 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPB1P53618 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPB1P53618 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPB1P53618 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPB1P53618 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPB1P53618 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPB1P53618 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPB1P53618 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPB1P53618 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPB1P53618 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPB1P53618 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
COPB1P53618 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPB1P53618 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPB1P53618 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPB1P53618 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPB1P53618 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPB1P53618 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPB1P53618 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPB1P53618 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPB1P53618 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPB1P53618 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPB1P53618 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPB1P53618 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPB1P53618 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPB1P53618 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPB1P53618 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPB1P53618 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPB1P53618 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPB1P53618 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPB1P53618 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPB1P53618 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPB1P53618 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPB1P53618 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPB1P53618 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPB1P53618 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPB1P53618 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPB1P53618 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPB1P53618 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPB1P53618 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COPB1P53618 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPB1P53618 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPB1P53618 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPB1P53618 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPB1P53618 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPB1P53618 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
COPB1P53618 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPB1P53618 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPB1P53618 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPB1P53618 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPB1P53618 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPB1P53618 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
COPB1P53618 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
COPB1P53618 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPB1P53618 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.7 ms