Protein–RNA interactions for Protein: A5PLL7

TMEM189, Transmembrane protein 189, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM189A5PLL7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM189A5PLL7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM189A5PLL7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM189A5PLL7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM189A5PLL7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM189A5PLL7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM189A5PLL7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM189A5PLL7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM189A5PLL7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM189A5PLL7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM189A5PLL7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM189A5PLL7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM189A5PLL7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM189A5PLL7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM189A5PLL7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM189A5PLL7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM189A5PLL7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM189A5PLL7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM189A5PLL7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM189A5PLL7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM189A5PLL7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM189A5PLL7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM189A5PLL7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM189A5PLL7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM189A5PLL7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM189A5PLL7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM189A5PLL7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM189A5PLL7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM189A5PLL7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM189A5PLL7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM189A5PLL7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM189A5PLL7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM189A5PLL7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM189A5PLL7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM189A5PLL7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms