Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VPREB3Q9UKI3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms