Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY7

USP33, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 33, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33Q8TEY7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP33Q8TEY7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP33Q8TEY7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms