Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ME3Q16798 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ME3Q16798 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ME3Q16798 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ME3Q16798 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ME3Q16798 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ME3Q16798 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ME3Q16798 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ME3Q16798 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ME3Q16798 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ME3Q16798 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ME3Q16798 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ME3Q16798 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ME3Q16798 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ME3Q16798 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ME3Q16798 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ME3Q16798 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ME3Q16798 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ME3Q16798 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ME3Q16798 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ME3Q16798 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ME3Q16798 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ME3Q16798 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ME3Q16798 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ME3Q16798 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ME3Q16798 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ME3Q16798 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ME3Q16798 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ME3Q16798 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ME3Q16798 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ME3Q16798 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ME3Q16798 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ME3Q16798 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ME3Q16798 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ME3Q16798 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ME3Q16798 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ME3Q16798 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ME3Q16798 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ME3Q16798 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ME3Q16798 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ME3Q16798 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ME3Q16798 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ME3Q16798 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ME3Q16798 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ME3Q16798 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ME3Q16798 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ME3Q16798 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ME3Q16798 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ME3Q16798 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ME3Q16798 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ME3Q16798 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ME3Q16798 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ME3Q16798 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ME3Q16798 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ME3Q16798 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ME3Q16798 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ME3Q16798 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ME3Q16798 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ME3Q16798 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ME3Q16798 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ME3Q16798 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ME3Q16798 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ME3Q16798 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ME3Q16798 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ME3Q16798 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ME3Q16798 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ME3Q16798 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ME3Q16798 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ME3Q16798 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ME3Q16798 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ME3Q16798 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ME3Q16798 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ME3Q16798 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ME3Q16798 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ME3Q16798 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ME3Q16798 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ME3Q16798 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ME3Q16798 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ME3Q16798 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ME3Q16798 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ME3Q16798 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ME3Q16798 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ME3Q16798 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ME3Q16798 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ME3Q16798 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ME3Q16798 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ME3Q16798 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ME3Q16798 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ME3Q16798 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ME3Q16798 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ME3Q16798 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ME3Q16798 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ME3Q16798 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ME3Q16798 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ME3Q16798 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ME3Q16798 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ME3Q16798 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ME3Q16798 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ME3Q16798 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ME3Q16798 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
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