Protein–RNA interactions for Protein: P48304

REG1B, Lithostathine-1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1BP48304 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
REG1BP48304 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
REG1BP48304 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
REG1BP48304 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
REG1BP48304 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
REG1BP48304 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
REG1BP48304 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
REG1BP48304 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
REG1BP48304 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
REG1BP48304 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
REG1BP48304 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
REG1BP48304 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
REG1BP48304 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
REG1BP48304 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
REG1BP48304 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
REG1BP48304 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
REG1BP48304 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
REG1BP48304 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
REG1BP48304 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
REG1BP48304 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
REG1BP48304 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
REG1BP48304 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
REG1BP48304 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
REG1BP48304 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
REG1BP48304 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
REG1BP48304 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
REG1BP48304 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
REG1BP48304 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
REG1BP48304 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
REG1BP48304 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
REG1BP48304 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
REG1BP48304 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
REG1BP48304 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
REG1BP48304 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
REG1BP48304 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
REG1BP48304 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
REG1BP48304 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
REG1BP48304 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
REG1BP48304 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
REG1BP48304 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
REG1BP48304 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
REG1BP48304 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
REG1BP48304 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
REG1BP48304 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
REG1BP48304 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
REG1BP48304 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
REG1BP48304 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
REG1BP48304 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
REG1BP48304 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
REG1BP48304 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
REG1BP48304 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
REG1BP48304 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
REG1BP48304 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
REG1BP48304 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
REG1BP48304 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
REG1BP48304 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
REG1BP48304 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
REG1BP48304 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
REG1BP48304 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
REG1BP48304 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
REG1BP48304 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
REG1BP48304 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
REG1BP48304 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
REG1BP48304 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
REG1BP48304 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
REG1BP48304 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
REG1BP48304 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
REG1BP48304 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
REG1BP48304 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
REG1BP48304 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
REG1BP48304 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
REG1BP48304 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
REG1BP48304 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
REG1BP48304 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
REG1BP48304 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
REG1BP48304 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
REG1BP48304 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
REG1BP48304 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
REG1BP48304 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
REG1BP48304 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
REG1BP48304 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
REG1BP48304 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
REG1BP48304 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
REG1BP48304 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
REG1BP48304 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
REG1BP48304 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
REG1BP48304 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
REG1BP48304 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
REG1BP48304 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
REG1BP48304 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
REG1BP48304 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
REG1BP48304 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
REG1BP48304 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
REG1BP48304 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
REG1BP48304 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
REG1BP48304 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
REG1BP48304 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
REG1BP48304 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
REG1BP48304 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
REG1BP48304 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms