Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHKA1P46020 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHKA1P46020 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHKA1P46020 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHKA1P46020 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHKA1P46020 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHKA1P46020 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PHKA1P46020 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PHKA1P46020 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHKA1P46020 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHKA1P46020 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHKA1P46020 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHKA1P46020 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHKA1P46020 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHKA1P46020 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PHKA1P46020 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PHKA1P46020 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PHKA1P46020 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHKA1P46020 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms