Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3KRW8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3KRW8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3KRW8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
J3KRW8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3KRW8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3KRW8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3KRW8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3KRW8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3KRW8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
J3KRW8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
J3KRW8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
J3KRW8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3KRW8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3KRW8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3KRW8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3KRW8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3KRW8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3KRW8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3KRW8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3KRW8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3KRW8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3KRW8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3KRW8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3KRW8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3KRW8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3KRW8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3KRW8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
J3KRW8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3KRW8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3KRW8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
J3KRW8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
J3KRW8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
J3KRW8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
J3KRW8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3KRW8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3KRW8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3KRW8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3KRW8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3KRW8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3KRW8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3KRW8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3KRW8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3KRW8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3KRW8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3KRW8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3KRW8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3KRW8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3KRW8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3KRW8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3KRW8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
J3KRW8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3KRW8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3KRW8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3KRW8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3KRW8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3KRW8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3KRW8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KRW8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KRW8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KRW8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KRW8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KRW8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KRW8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KRW8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KRW8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KRW8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KRW8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KRW8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KRW8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KRW8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KRW8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KRW8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KRW8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KRW8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KRW8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KRW8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KRW8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KRW8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KRW8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KRW8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KRW8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KRW8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KRW8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KRW8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KRW8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KRW8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3KRW8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3KRW8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3KRW8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3KRW8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3KRW8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3KRW8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3KRW8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3KRW8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3KRW8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3KRW8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3KRW8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3KRW8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3KRW8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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