Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHMG1C9JSJ3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms