Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC78A2IDD5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms