Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKAP2LQ8IYA6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKAP2LQ8IYA6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms