Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
COL24A1Q17RW2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1628.5 ms