Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL4AQ13619 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
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