Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TRIM28Q13263 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM28Q13263 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
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