Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 YSF3YNL138W-A 258 nt3.68□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 SNO2YNL334C 669 nt3.68□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 NAT1YDL040C 2565 nt3.68□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 PRP3YDR473C 1410 nt3.68□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 GPI13YLL031C 3054 nt3.67□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 VPS53YJL029C 2469 nt3.67□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 YOR365CYOR365C 2112 nt3.67□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 MCD4YKL165C 2760 nt3.67□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 YPR003CYPR003C 2265 nt3.67□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 POL1YNL102W 4407 nt3.67□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 RRN6YBL014C 2685 nt3.67□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 TRX3YCR083W 384 nt3.67□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 ERP3YDL018C 678 nt3.67□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 YDR355CYDR355C 303 nt3.67□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 YJR141WYJR141W 1044 nt3.67□□□□□ -1.82 RIP-Chip
PUF2Q12221 SSO2YMR183C 888 nt3.67□□□□□ -1.82 RIP-Chip
PUF2Q12221 YPR078CYPR078C 1119 nt3.67□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 YPR172WYPR172W 603 nt3.67□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 KIN3YAR018C 1308 nt3.67□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 PDR12YPL058C 4536 nt3.67□□□□□ -1.82 RIP-Chip
PUF2Q12221 VID28YIL017C 2766 nt3.66□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 AEP3YPL005W 1821 nt3.66□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 MSD1YPL104W 1977 nt3.66□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 YAP6YDR259C 1152 nt3.66□□□□□ -1.82 RIP-Chip
PUF2Q12221 NKP1YDR383C 717 nt3.66□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 MTC3YGL226W 372 nt3.66□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 RPS25AYGR027C 327 nt3.66□□□□□ -1.82 RIP-Chip
PUF2Q12221 YGR126WYGR126W 693 nt3.66□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 RPN13YLR421C 471 nt3.66□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 IRC21YMR073C 606 nt3.66□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 MEI5YPL121C 669 nt3.66□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 PIN3YPR154W 648 nt3.66□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 YBR103C-AYBR103C-A 144 nt3.66□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 DER1YBR201W 636 nt3.66□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 SNF2YOR290C 5112 nt3.66□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 SDS23YGL056C 1584 nt3.66□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 SEG1YMR086W 2883 nt3.66□□□□□ -1.82 RIP-Chip
PUF2Q12221 YBR238CYBR238C 2196 nt3.66□□□□□ -1.82
PUF2Q12221 FAD1YDL045C 921 nt3.65□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 HMO1YDR174W 741 nt3.65□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 KEI1YDR367W 666 nt3.65□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 RSM18YER050C 417 nt3.65□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 YGR026WYGR026W 837 nt3.65□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 COX2Q0250 756 nt3.65□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt3.65□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 YHR180WYHR180W 492 nt3.65□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 RFC5YBR087W 1065 nt3.65□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 UTP25YIL091C 2166 nt3.65□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 NUP85YJR042W 2235 nt3.64□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 YDL016CYDL016C 303 nt3.64□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 TGL2YDR058C 981 nt3.64□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 FMP32YFL046W 624 nt3.64□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 YGL082WYGL082W 1146 nt3.64□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 MND1YGL183C 660 nt3.64□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 RNR2YJL026W 1200 nt3.64□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 BET4YJL031C 984 nt3.64□□□□□ -1.83 RIP-Chip
PUF2Q12221 YOL029CYOL029C 606 nt3.64□□□□□ -1.83 RIP-Chip
PUF2Q12221 BRX1YOL077C 876 nt3.64□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 PET123YOR158W 957 nt3.64□□□□□ -1.83 RIP-Chip
PUF2Q12221 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt3.64□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 SRO7YPR032W 3102 nt3.64□□□□□ -1.83 RIP-Chip
PUF2Q12221 CDC14YFR028C 1656 nt3.64□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 PPZ1YML016C 2079 nt3.64□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 UBP12YJL197W 3765 nt3.64□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 CDC37YDR168W 1521 nt3.64□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 MSS4YDR208W 2340 nt3.64□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 HFD1YMR110C 1599 nt3.63□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 ARP9YMR033W 1404 nt3.63□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 APE2YKL157W 2859 nt3.63□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 CUE3YGL110C 1875 nt3.63□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 RGI1YER067W 486 nt3.63□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 RIM4YHL024W 2142 nt3.63□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 CCE1YKL011C 1062 nt3.63□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 TMA19YKL056C 504 nt3.63□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 GIM3YNL153C 390 nt3.63□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 IDH2YOR136W 1110 nt3.63□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 RPS10AYOR293W 318 nt3.63□□□□□ -1.83 RIP-Chip
PUF2Q12221 SPR3YGR059W 1539 nt3.63□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 DBP3YGL078C 1572 nt3.63□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 SEC59YMR013C 1560 nt3.63□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 NTH1YDR001C 2256 nt3.63□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 AGE1YDR524C 1449 nt3.62□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 PEP7YDR323C 1548 nt3.62□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 RIM1YCR028C-A 408 nt3.62□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 BSC2YDR275W 708 nt3.62□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt3.62□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 MTM1YGR257C 1101 nt3.62□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 LIN1YHR156C 1023 nt3.62□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 YPT7YML001W 627 nt3.62□□□□□ -1.83 RIP-Chip
PUF2Q12221 TPM1YNL079C 600 nt3.62□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 RPL18AYOL120C 561 nt3.62□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 DDP1YOR163W 567 nt3.62□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 POL30YBR088C 777 nt3.62□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 ARL1YBR164C 552 nt3.62□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 YBR242WYBR242W 717 nt3.62□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 YRM1YOR172W 2361 nt3.62□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 GPI10YGL142C 1851 nt3.62□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 CTM1YHR109W 1758 nt3.61□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 IMH1YLR309C 2736 nt3.61□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 ZDS1YMR273C 2748 nt3.61□□□□□ -1.83
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