Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 RSM28YDR494W 1086 nt4.74□□□□□ -1.65
SSF2Q12153 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt4.74□□□□□ -1.65
SSF2Q12153 YGL088WYGL088W 366 nt4.74□□□□□ -1.65
SSF2Q12153 YOR203WYOR203W 354 nt4.74□□□□□ -1.65
SSF2Q12153 MEI5YPL121C 669 nt4.74□□□□□ -1.65
SSF2Q12153 snR24snR24 89 nt4.74□□□□□ -1.65
SSF2Q12153 TSR1YDL060W 2367 nt4.73□□□□□ -1.65
SSF2Q12153 DIP2YLR129W 2832 nt4.73□□□□□ -1.65
SSF2Q12153 HOM2YDR158W 1098 nt4.73□□□□□ -1.65
SSF2Q12153 GIC1YHR061C 945 nt4.73□□□□□ -1.65
SSF2Q12153 YIR014WYIR014W 729 nt4.73□□□□□ -1.65
SSF2Q12153 ENT3YJR125C 1227 nt4.73□□□□□ -1.65
SSF2Q12153 YKL202WYKL202W 582 nt4.73□□□□□ -1.65
SSF2Q12153 YPR059CYPR059C 387 nt4.73□□□□□ -1.65
SSF2Q12153 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt4.73□□□□□ -1.65
SSF2Q12153 ADF1YCL058W-A 342 nt4.73□□□□□ -1.65
SSF2Q12153 STE24YJR117W 1362 nt4.73□□□□□ -1.65
SSF2Q12153 TPO5YKL174C 1857 nt4.73□□□□□ -1.65
SSF2Q12153 CWH43YCR017C 2862 nt4.72□□□□□ -1.65
SSF2Q12153 YCR108CYCR108C 192 nt4.72□□□□□ -1.65
SSF2Q12153 snR84snR84 550 nt4.72□□□□□ -1.65
SSF2Q12153 MCA1YOR197W 1299 nt4.72□□□□□ -1.65
SSF2Q12153 ARP5YNL059C 2268 nt4.72□□□□□ -1.65
SSF2Q12153 MDR1YGR100W 2853 nt4.72□□□□□ -1.65
SSF2Q12153 YSH1YLR277C 2340 nt4.72□□□□□ -1.65
SSF2Q12153 ARO80YDR421W 2853 nt4.71□□□□□ -1.65
SSF2Q12153 KRE29YER038C 1395 nt4.71□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 YCR013CYCR013C 648 nt4.71□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 ELO2YCR034W 1044 nt4.71□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 HMRA1YCR097W 381 nt4.71□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 EMC2YJR088C 879 nt4.71□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 PIR1YKL164C 1026 nt4.71□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 CSM4YPL200W 471 nt4.71□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 FRM2YCL026C-A 582 nt4.71□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 FYV5YCL058C 459 nt4.71□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 XKS1YGR194C 1803 nt4.71□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 YOL153CYOL153C 1746 nt4.71□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 PRM15YMR278W 1869 nt4.71□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 KRE2YDR483W 1329 nt4.71□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 AIM21YIR003W 2040 nt4.7□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 AEP2YMR282C 1743 nt4.7□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 snR68snR68 136 nt4.7□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 RRP42YDL111C 798 nt4.7□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 VAB2YEL005C 849 nt4.7□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 PEA2YER149C 1263 nt4.7□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 YGL082WYGL082W 1146 nt4.7□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 HUB1YNR032C-A 222 nt4.7□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 TSR4YOL022C 1227 nt4.7□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 MIP6YHR015W 1980 nt4.7□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 MTR10YOR160W 2919 nt4.7□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 PRP28YDR243C 1767 nt4.7□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 snR9snR9 187 nt4.69□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 THO1YER063W 657 nt4.69□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 YIL014C-AYIL014C-A 315 nt4.69□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 VMA5YKL080W 1179 nt4.69□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 YNL276CYNL276C 396 nt4.69□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 PHO88YBR106W 567 nt4.69□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 LOS1YKL205W 3303 nt4.69□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 ANR2YKL047W 1551 nt4.69□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 RIM21YNL294C 1602 nt4.68□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 PHO84YML123C 1764 nt4.68□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 PBP4YDL053C 558 nt4.68□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 SPC19YDR201W 498 nt4.68□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 BTT1YDR252W 450 nt4.68□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 MFA1YDR461W 111 nt4.68□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 YJL114WYJL114W 681 nt4.68□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 YJR087WYJR087W 351 nt4.68□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 AIM25YJR100C 984 nt4.68□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 YRO2YBR054W 1035 nt4.68□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 SEC2YNL272C 2280 nt4.68□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 FUS2YMR232W 2034 nt4.68□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 HSP30YCR021C 999 nt4.67□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 CGR1YGL029W 363 nt4.67□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 Q0142Q0142 177 nt4.67□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 SOL4YGR248W 768 nt4.67□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 QCR10YHR001W-A 234 nt4.67□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 LRP1YHR081W 555 nt4.67□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 AIM22YJL046W 1230 nt4.67□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 RPL14AYKL006W 417 nt4.67□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 YNL203CYNL203C 612 nt4.67□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 RPS19AYOL121C 435 nt4.67□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 YBR103C-AYBR103C-A 144 nt4.67□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 CHL1YPL008W 2586 nt4.67□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 MCD4YKL165C 2760 nt4.67□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 GCN5YGR252W 1320 nt4.67□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 EBS1YDR206W 2655 nt4.67□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 ASI1YMR119W 1875 nt4.66□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt4.66□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 PSP1YDR505C 2526 nt4.66□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 snR5snR5 204 nt4.66□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 YDR018CYDR018C 1191 nt4.66□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 TAM41YGR046W 1158 nt4.66□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 YHL049CYHL049C 816 nt4.66□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt4.66□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 DSE2YHR143W 978 nt4.66□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 RPL17AYKL180W 555 nt4.66□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 COQ9YLR201C 783 nt4.66□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 PRM6YML047C 1059 nt4.66□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 RUF22RUF22 515 nt4.66□□□□□ -1.66
SSF2Q12153 CDC21YOR074C 915 nt4.66□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.3 ms