Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC63Q05C16 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms