Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BHMG1C9JSJ3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHMG1C9JSJ3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms