Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
KRT87PA6NCN2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRT87PA6NCN2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRT87PA6NCN2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRT87PA6NCN2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRT87PA6NCN2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRT87PA6NCN2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRT87PA6NCN2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRT87PA6NCN2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRT87PA6NCN2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRT87PA6NCN2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRT87PA6NCN2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRT87PA6NCN2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT87PA6NCN2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms