Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RABGEF1Q9UJ41 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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RABGEF1Q9UJ41 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABGEF1Q9UJ41 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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