Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSEN34Q9BSV6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms