Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1CQ15572 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1CQ15572 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
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