Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SS18Q15532 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SS18Q15532 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SS18Q15532 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SS18Q15532 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SS18Q15532 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SS18Q15532 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SS18Q15532 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SS18Q15532 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SS18Q15532 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SS18Q15532 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SS18Q15532 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SS18Q15532 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SS18Q15532 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SS18Q15532 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SS18Q15532 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SS18Q15532 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18Q15532 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18Q15532 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18Q15532 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18Q15532 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18Q15532 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18Q15532 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18Q15532 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18Q15532 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18Q15532 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18Q15532 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18Q15532 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18Q15532 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18Q15532 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18Q15532 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18Q15532 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18Q15532 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18Q15532 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18Q15532 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18Q15532 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18Q15532 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18Q15532 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18Q15532 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18Q15532 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18Q15532 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18Q15532 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18Q15532 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18Q15532 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18Q15532 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18Q15532 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SS18Q15532 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SS18Q15532 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SS18Q15532 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SS18Q15532 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SS18Q15532 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SS18Q15532 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SS18Q15532 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SS18Q15532 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SS18Q15532 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SS18Q15532 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SS18Q15532 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SS18Q15532 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SS18Q15532 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SS18Q15532 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SS18Q15532 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SS18Q15532 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SS18Q15532 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SS18Q15532 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SS18Q15532 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SS18Q15532 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SS18Q15532 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18Q15532 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18Q15532 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18Q15532 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18Q15532 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18Q15532 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18Q15532 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18Q15532 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18Q15532 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18Q15532 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18Q15532 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18Q15532 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18Q15532 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18Q15532 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18Q15532 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18Q15532 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18Q15532 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18Q15532 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18Q15532 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18Q15532 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18Q15532 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18Q15532 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18Q15532 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18Q15532 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18Q15532 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18Q15532 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18Q15532 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SS18Q15532 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SS18Q15532 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SS18Q15532 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SS18Q15532 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SS18Q15532 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SS18Q15532 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SS18Q15532 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms