Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CUL4AQ13619 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL4AQ13619 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
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